三国志战略版船坞存在赛季、建筑等级、资源、舰船库存及水军适性五类核心限制，仅赤壁之战剧本可建造，且受君王殿等级和资源消耗约束，舰船战败会损毁，顶级特性需逐级解开。

船坞的赛季和建筑前提限制最基础，仅赤壁之战剧本放开船坞建造，常规赛季无此建筑。建造船坞前，君王殿必须达到8级，这是硬性门槛，未达标时无法解开船坞建造入口。船坞顶尖3级，更新需消耗大量木材、铁矿、石料，资源需求高于普通建筑，前期资源分配紧张时难以快速成型。

船坞关联的水军适性和舰船解开存在双重限制。船坞等级直接决定武将水军适性上限，1-2级仅小幅提高，3级满级时上阵武将水军适性统一提高至A级，初始B、C级武将才能解开高阶水战能力。顶级舰船蒙冲、斗舰、楼船需船坞1级解开基础建造权，2级解开中级特性，3级解开顶级特性，特性不全时顶级舰船战力受限。基础舰船走舸虽解开即有，但无属性加成，仅为过渡选择。

舰船库存和战败损耗是实战核心限制。顶级舰船为消耗品，水上战斗战败会直接损毁，需从头消耗资源建造，战平撤退或陆地战败则无损耗。船坞库存不足时，部队只能强制装备走舸出战，战力大幅下降，因此需持续预留资源补建舰船，避免库存见底影响水战部署。每格水路最多停留10支部队，大规模水战时需分批调度，防止拥堵导致战机延误。

船坞方法的延伸限制影响战略布局。同盟秘策焚舟炬敌需船坞和同盟等级双达标才能解开，个人无法激活，依赖同盟协作。港口城市附近不可迁城，水战核心区域选址受限，需提前规划城池位置，避免影响水路补给和登陆作战。水军适性不足时，武将水上战斗会触发属性减益，C级适性武将全属性降低5%，强行出战易遭碾压，需优先培养适性或组合船坞等级弥补短板。