原版游戏内本身存在前往八岛和九岛的固定渡轮航线，不会在常规码头列表中直接显示，只有满足对应前置条件并持有唯一道具之后，航线才会自动解开，无道具的前提下无论完成几许主线支线，码头水手都不会提供前往两处岛屿的航行选项。整个橘子群岛的全部航线全部由海烈焰马号承担运输职业，一至七岛依靠通行证划分航线权限，八岛和九岛属于隐藏航线，被游戏机制做了封锁处理，航线本身一直存在，只是处于隐藏锁定情形，这也是大量玩家通关全剧情后依然无法坐船前往隐藏岛屿的核心缘故，很多改版直接解开码头航线，本质就是关掉了道具判定，强行调出被隐藏的航班选项。

想要调出隐藏航线，首先需要完成全部解开航线的硬性前置内容，需要集齐六十只捕获记录的宝可梦，前往大木博士处把图鉴更新为全国图鉴，随后前往一岛的宝可梦网络中心承接锦辉的任务，前往灯火山洞穴取得红宝石交付之后，再潜入五岛的火箭队仓库拿到蓝宝石，修复宝可梦联网设备之后即可获取七彩通行证，持有该通行证才能解开全部常规岛屿航线，同时解除隐藏航线的底层锁定限制。此时码头已经具备了加载八岛、九岛航线的基础条件，只需要补充对应的唯一船票，码头的航行菜单就会新增两个隐藏目的地，神奇船票对应八岛肚脐岩，极光船票对应九岛诞生之岛，两张道具相互独立，只持有其中一张，就只会解开对应岛屿的单程航班，无法前往另一处隐藏岛屿。

原版正版卡带中，两张船票只能通过线下线下配信活动主题发放，常规游玩流程不存在任何可以获取船票的方法，简体汉化改版大多屏蔽了神奇礼物功能，即便在商店留言簿输入指定字符开始神奇礼物，也无法联机领取活动主题道具，这也是汉化版永远无法正常调出航班的决定因素。想要正常调用码头航班，除了修改背包添加船票之外，也可以利用金手指直接开始航线判定，不需要传送代码，添加船票之后前往枯叶市码头和水手对话，航行列表就会出现肚脐岩和诞生之岛的选项，航线支持反复往返，离开岛屿之后再次前往码头，依然可以重复乘船，不会出现航线永久消失的情况。抵达八岛后可以在洞穴深处依次捕捉洛奇亚和凤王，两处神兽的出现顺序会随着行进路线发生变化，九岛则存在陨石解谜机制，需要全程走最短途径触碰移动的三角，直到陨石变红碎裂之后，才会出现代欧奇希斯，捕捉失败后离开岛屿再从头坐船进入，陨石谜题会自动重置，可以反复尝试捕捉。

不少玩家会运用定点传送代码直达两处岛屿，这种方法会绕过航线判定，无法尝试正常乘船机制，同时极易出现地图卡死、道具丢失、存档损坏的难题，添加船票解开航班是稳定性顶尖的方法，通关后还可以利用隐藏岛屿反复刷取经验道具，八岛洞穴内分布着大量高等级野生宝可梦，适合用来培育队伍，也可以携带捕虫刷来反复拾取隐藏道具。另外需要注意，千万不要在持有船票的情形下丢弃道具，一旦丢弃，隐藏航线会立刻从码头菜单中消失，只能从头获取船票才能再次解开航班，七彩通行证也不能提前丢弃，丢失通行证之后，全部橘子群岛航线都会被一并封锁，隐藏航班也会随之失效。